Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp35M0QWN7 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Usp35M0QWN7 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Usp35M0QWN7 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Usp35M0QWN7 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Usp35M0QWN7 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Usp35M0QWN7 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Usp35M0QWN7 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Usp35M0QWN7 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Usp35M0QWN7 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Usp35M0QWN7 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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