Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Gm2288-201ENSMUST00000118560 638 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Sult1b1-203ENSMUST00000120150 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Gm12748-201ENSMUST00000120763 504 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Gm11279-201ENSMUST00000121524 1256 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Platr28-201ENSMUST00000133824 1294 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Gm16284-201ENSMUST00000140995 400 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Gm5125-201ENSMUST00000148614 624 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
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Gm21887J3QQ04 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Gm28541-201ENSMUST00000185206 442 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Gm37853-201ENSMUST00000195748 660 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Gm37134-201ENSMUST00000195810 628 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Gm40155-201ENSMUST00000198291 818 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
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Gm21887J3QQ04 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
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Gm21887J3QQ04 Fsip1-201ENSMUST00000028820 1025 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Klrk1-201ENSMUST00000032252 1270 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
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Gm21887J3QQ04 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
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Gm21887J3QQ04 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Gm43340-201ENSMUST00000200448 1344 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
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Gm21887J3QQ04 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
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Gm21887J3QQ04 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
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Gm21887J3QQ04 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
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Gm21887J3QQ04 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
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Gm21887J3QQ04 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
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Gm21887J3QQ04 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
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Gm21887J3QQ04 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
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Gm21887J3QQ04 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
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Gm21887J3QQ04 Redrum-201ENSMUST00000181269 1774 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
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Gm21887J3QQ04 Gm14864-201ENSMUST00000116164 1087 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Gm12383-201ENSMUST00000120628 760 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
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Gm21887J3QQ04 Defa-ps16-201ENSMUST00000121939 171 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Gm15245-201ENSMUST00000129410 1186 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Crem-222ENSMUST00000144496 978 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Gm22693-201ENSMUST00000175049 442 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Gm28298-201ENSMUST00000185287 622 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Gm28127-201ENSMUST00000185293 622 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Gm28176-201ENSMUST00000185322 622 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Gm29532-201ENSMUST00000185593 622 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms