Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms