Protein–RNA interactions for Protein: J3QM43

Gm6594, Predicted pseudogene 6594, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6594J3QM43 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6594J3QM43 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms