Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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