Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Gm21411J3KMS0 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Gm21411J3KMS0 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Gm21411J3KMS0 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Gm21411J3KMS0 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Gm21411J3KMS0 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Gm21411J3KMS0 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Gm21411J3KMS0 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Gm21411J3KMS0 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Gm21411J3KMS0 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Gm21411J3KMS0 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gm21411J3KMS0 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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