Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
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Gm20830J3KML6 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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