Protein–RNA interactions for Protein: H7BX78

Zfp408, Zinc finger protein 408, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp408H7BX78 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms