Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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H2-M1F7CXU4 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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H2-M1F7CXU4 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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H2-M1F7CXU4 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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H2-M1F7CXU4 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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H2-M1F7CXU4 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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H2-M1F7CXU4 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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H2-M1F7CXU4 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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H2-M1F7CXU4 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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