Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gm8005F6YKY3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
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