Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
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