Protein–RNA interactions for Protein: F6RFI0

Gm9887, Predicted gene 9887, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9887F6RFI0 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9887F6RFI0 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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