Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms