Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt78E9Q0F0 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt78E9Q0F0 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt78E9Q0F0 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt78E9Q0F0 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt78E9Q0F0 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt78E9Q0F0 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt78E9Q0F0 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt78E9Q0F0 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt78E9Q0F0 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt78E9Q0F0 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt78E9Q0F0 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt78E9Q0F0 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt78E9Q0F0 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt78E9Q0F0 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt78E9Q0F0 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt78E9Q0F0 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt78E9Q0F0 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt78E9Q0F0 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt78E9Q0F0 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt78E9Q0F0 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt78E9Q0F0 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt78E9Q0F0 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt78E9Q0F0 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt78E9Q0F0 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt78E9Q0F0 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt78E9Q0F0 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt78E9Q0F0 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt78E9Q0F0 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt78E9Q0F0 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt78E9Q0F0 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt78E9Q0F0 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt78E9Q0F0 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt78E9Q0F0 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt78E9Q0F0 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt78E9Q0F0 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt78E9Q0F0 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt78E9Q0F0 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt78E9Q0F0 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt78E9Q0F0 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt78E9Q0F0 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt78E9Q0F0 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt78E9Q0F0 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt78E9Q0F0 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt78E9Q0F0 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt78E9Q0F0 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt78E9Q0F0 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt78E9Q0F0 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt78E9Q0F0 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt78E9Q0F0 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt78E9Q0F0 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt78E9Q0F0 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt78E9Q0F0 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt78E9Q0F0 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt78E9Q0F0 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt78E9Q0F0 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt78E9Q0F0 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt78E9Q0F0 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt78E9Q0F0 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Krt78E9Q0F0 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Krt78E9Q0F0 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms