Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms