Protein–RNA interactions for Protein: E9PXB6

Sfta2, Surfactant-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfta2E9PXB6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms