Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3002E9PW72 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3002E9PW72 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3002E9PW72 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3002E9PW72 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3002E9PW72 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3002E9PW72 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3002E9PW72 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3002E9PW72 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3002E9PW72 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3002E9PW72 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3002E9PW72 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3002E9PW72 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3002E9PW72 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3002E9PW72 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3002E9PW72 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3002E9PW72 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3002E9PW72 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3002E9PW72 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3002E9PW72 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3002E9PW72 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3002E9PW72 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3002E9PW72 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3002E9PW72 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3002E9PW72 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3002E9PW72 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3002E9PW72 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3002E9PW72 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3002E9PW72 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3002E9PW72 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3002E9PW72 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3002E9PW72 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3002E9PW72 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3002E9PW72 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3002E9PW72 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3002E9PW72 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3002E9PW72 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3002E9PW72 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3002E9PW72 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3002E9PW72 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3002E9PW72 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3002E9PW72 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3002E9PW72 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3002E9PW72 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3002E9PW72 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3002E9PW72 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3002E9PW72 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3002E9PW72 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3002E9PW72 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm3002E9PW72 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm3002E9PW72 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm3002E9PW72 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm3002E9PW72 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm3002E9PW72 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3002E9PW72 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3002E9PW72 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
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Gm3002E9PW72 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3002E9PW72 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3002E9PW72 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Gm3002E9PW72 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3002E9PW72 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3002E9PW72 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Gm3002E9PW72 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Gm3002E9PW72 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3002E9PW72 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Gm3002E9PW72 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3002E9PW72 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Gm3002E9PW72 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3002E9PW72 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3002E9PW72 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3002E9PW72 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3002E9PW72 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3002E9PW72 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3002E9PW72 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3002E9PW72 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm3002E9PW72 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3002E9PW72 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3002E9PW72 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3002E9PW72 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3002E9PW72 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.07■□□□□ 0
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