Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ttc17E9PVB5 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ttc17E9PVB5 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ttc17E9PVB5 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ttc17E9PVB5 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ttc17E9PVB5 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ttc17E9PVB5 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ttc17E9PVB5 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ttc17E9PVB5 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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