Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms