Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms