Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms