Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
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Ccdc6D3YZP9 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
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