Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms