Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms