Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms