Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms