Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms