Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms