Protein–RNA interactions for Protein: B1AYL1

Scn7a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn7aB1AYL1 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scn7aB1AYL1 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms