Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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