Protein–RNA interactions for Protein: B1AQJ2

Usp36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp36B1AQJ2 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp36B1AQJ2 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp36B1AQJ2 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp36B1AQJ2 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp36B1AQJ2 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp36B1AQJ2 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp36B1AQJ2 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp36B1AQJ2 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp36B1AQJ2 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp36B1AQJ2 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp36B1AQJ2 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp36B1AQJ2 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp36B1AQJ2 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp36B1AQJ2 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp36B1AQJ2 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp36B1AQJ2 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp36B1AQJ2 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp36B1AQJ2 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp36B1AQJ2 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp36B1AQJ2 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp36B1AQJ2 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp36B1AQJ2 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp36B1AQJ2 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp36B1AQJ2 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp36B1AQJ2 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp36B1AQJ2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp36B1AQJ2 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp36B1AQJ2 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp36B1AQJ2 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms