Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms