Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf39A2RT81 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf39A2RT81 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf39A2RT81 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf39A2RT81 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf39A2RT81 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf39A2RT81 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf39A2RT81 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf39A2RT81 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf39A2RT81 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf39A2RT81 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf39A2RT81 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf39A2RT81 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf39A2RT81 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf39A2RT81 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf39A2RT81 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf39A2RT81 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf39A2RT81 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf39A2RT81 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf39A2RT81 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf39A2RT81 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf39A2RT81 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf39A2RT81 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf39A2RT81 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf39A2RT81 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf39A2RT81 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf39A2RT81 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf39A2RT81 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf39A2RT81 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf39A2RT81 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf39A2RT81 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf39A2RT81 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf39A2RT81 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf39A2RT81 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf39A2RT81 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf39A2RT81 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf39A2RT81 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf39A2RT81 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf39A2RT81 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf39A2RT81 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf39A2RT81 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf39A2RT81 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf39A2RT81 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf39A2RT81 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf39A2RT81 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf39A2RT81 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf39A2RT81 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf39A2RT81 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf39A2RT81 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf39A2RT81 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf39A2RT81 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf39A2RT81 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf39A2RT81 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf39A2RT81 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf39A2RT81 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf39A2RT81 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf39A2RT81 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf39A2RT81 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf39A2RT81 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf39A2RT81 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf39A2RT81 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf39A2RT81 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf39A2RT81 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf39A2RT81 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf39A2RT81 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf39A2RT81 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf39A2RT81 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf39A2RT81 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf39A2RT81 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf39A2RT81 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf39A2RT81 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf39A2RT81 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf39A2RT81 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf39A2RT81 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf39A2RT81 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf39A2RT81 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf39A2RT81 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf39A2RT81 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf39A2RT81 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf39A2RT81 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf39A2RT81 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf39A2RT81 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf39A2RT81 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf39A2RT81 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf39A2RT81 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf39A2RT81 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf39A2RT81 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf39A2RT81 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf39A2RT81 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf39A2RT81 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf39A2RT81 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf39A2RT81 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf39A2RT81 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf39A2RT81 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf39A2RT81 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf39A2RT81 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf39A2RT81 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf39A2RT81 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf39A2RT81 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf39A2RT81 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms