Protein–RNA interactions for Protein: A2AM80

Fam43b, Family with sequence similarity 43, member B, mousemouse

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam43bA2AM80 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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Fam43bA2AM80 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Fam43bA2AM80 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam43bA2AM80 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam43bA2AM80 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam43bA2AM80 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Fam43bA2AM80 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Fam43bA2AM80 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam43bA2AM80 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam43bA2AM80 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam43bA2AM80 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam43bA2AM80 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam43bA2AM80 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam43bA2AM80 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam43bA2AM80 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam43bA2AM80 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Fam43bA2AM80 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Fam43bA2AM80 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam43bA2AM80 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam43bA2AM80 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Fam43bA2AM80 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam43bA2AM80 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Fam43bA2AM80 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Fam43bA2AM80 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam43bA2AM80 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam43bA2AM80 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam43bA2AM80 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam43bA2AM80 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam43bA2AM80 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam43bA2AM80 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam43bA2AM80 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam43bA2AM80 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam43bA2AM80 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam43bA2AM80 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam43bA2AM80 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam43bA2AM80 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam43bA2AM80 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam43bA2AM80 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam43bA2AM80 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam43bA2AM80 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam43bA2AM80 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam43bA2AM80 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam43bA2AM80 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam43bA2AM80 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Fam43bA2AM80 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms