Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms