Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm12A2AJ77 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms