Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC8.32□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC8.31□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
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