Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mbd1Q9Z2E2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mbd1Q9Z2E2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mbd1Q9Z2E2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mbd1Q9Z2E2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mbd1Q9Z2E2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mbd1Q9Z2E2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mbd1Q9Z2E2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mbd1Q9Z2E2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mbd1Q9Z2E2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mbd1Q9Z2E2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mbd1Q9Z2E2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mbd1Q9Z2E2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mbd1Q9Z2E2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mbd1Q9Z2E2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mbd1Q9Z2E2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mbd1Q9Z2E2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mbd1Q9Z2E2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mbd1Q9Z2E2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mbd1Q9Z2E2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mbd1Q9Z2E2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mbd1Q9Z2E2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mbd1Q9Z2E2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mbd1Q9Z2E2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mbd1Q9Z2E2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mbd1Q9Z2E2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mbd1Q9Z2E2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mbd1Q9Z2E2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mbd1Q9Z2E2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mbd1Q9Z2E2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mbd1Q9Z2E2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mbd1Q9Z2E2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Mbd1Q9Z2E2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mbd1Q9Z2E2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mbd1Q9Z2E2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mbd1Q9Z2E2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mbd1Q9Z2E2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mbd1Q9Z2E2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mbd1Q9Z2E2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mbd1Q9Z2E2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mbd1Q9Z2E2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mbd1Q9Z2E2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mbd1Q9Z2E2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Mbd1Q9Z2E2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mbd1Q9Z2E2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mbd1Q9Z2E2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mbd1Q9Z2E2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mbd1Q9Z2E2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mbd1Q9Z2E2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mbd1Q9Z2E2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mbd1Q9Z2E2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mbd1Q9Z2E2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mbd1Q9Z2E2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mbd1Q9Z2E2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mbd1Q9Z2E2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mbd1Q9Z2E2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mbd1Q9Z2E2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mbd1Q9Z2E2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Mbd1Q9Z2E2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mbd1Q9Z2E2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mbd1Q9Z2E2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mbd1Q9Z2E2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mbd1Q9Z2E2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mbd1Q9Z2E2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mbd1Q9Z2E2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mbd1Q9Z2E2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mbd1Q9Z2E2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Mbd1Q9Z2E2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Mbd1Q9Z2E2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Mbd1Q9Z2E2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mbd1Q9Z2E2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mbd1Q9Z2E2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mbd1Q9Z2E2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mbd1Q9Z2E2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mbd1Q9Z2E2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mbd1Q9Z2E2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mbd1Q9Z2E2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mbd1Q9Z2E2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Mbd1Q9Z2E2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mbd1Q9Z2E2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mbd1Q9Z2E2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mbd1Q9Z2E2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mbd1Q9Z2E2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mbd1Q9Z2E2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mbd1Q9Z2E2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Mbd1Q9Z2E2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mbd1Q9Z2E2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mbd1Q9Z2E2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mbd1Q9Z2E2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mbd1Q9Z2E2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Mbd1Q9Z2E2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Mbd1Q9Z2E2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mbd1Q9Z2E2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mbd1Q9Z2E2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mbd1Q9Z2E2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mbd1Q9Z2E2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mbd1Q9Z2E2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mbd1Q9Z2E2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mbd1Q9Z2E2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mbd1Q9Z2E2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.8 ms