Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E1

Mbd2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd2Q9Z2E1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mbd2Q9Z2E1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mbd2Q9Z2E1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Mbd2Q9Z2E1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mbd2Q9Z2E1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mbd2Q9Z2E1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mbd2Q9Z2E1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mbd2Q9Z2E1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mbd2Q9Z2E1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Mbd2Q9Z2E1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mbd2Q9Z2E1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mbd2Q9Z2E1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mbd2Q9Z2E1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mbd2Q9Z2E1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mbd2Q9Z2E1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mbd2Q9Z2E1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mbd2Q9Z2E1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mbd2Q9Z2E1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mbd2Q9Z2E1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mbd2Q9Z2E1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mbd2Q9Z2E1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mbd2Q9Z2E1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mbd2Q9Z2E1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mbd2Q9Z2E1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Mbd2Q9Z2E1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mbd2Q9Z2E1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mbd2Q9Z2E1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mbd2Q9Z2E1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mbd2Q9Z2E1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mbd2Q9Z2E1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mbd2Q9Z2E1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mbd2Q9Z2E1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mbd2Q9Z2E1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mbd2Q9Z2E1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mbd2Q9Z2E1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mbd2Q9Z2E1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mbd2Q9Z2E1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mbd2Q9Z2E1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mbd2Q9Z2E1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mbd2Q9Z2E1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mbd2Q9Z2E1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mbd2Q9Z2E1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mbd2Q9Z2E1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mbd2Q9Z2E1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mbd2Q9Z2E1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mbd2Q9Z2E1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mbd2Q9Z2E1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mbd2Q9Z2E1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mbd2Q9Z2E1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mbd2Q9Z2E1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mbd2Q9Z2E1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mbd2Q9Z2E1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mbd2Q9Z2E1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Mbd2Q9Z2E1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Mbd2Q9Z2E1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mbd2Q9Z2E1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mbd2Q9Z2E1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mbd2Q9Z2E1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mbd2Q9Z2E1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mbd2Q9Z2E1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mbd2Q9Z2E1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Mbd2Q9Z2E1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mbd2Q9Z2E1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mbd2Q9Z2E1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mbd2Q9Z2E1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mbd2Q9Z2E1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mbd2Q9Z2E1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mbd2Q9Z2E1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mbd2Q9Z2E1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mbd2Q9Z2E1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Mbd2Q9Z2E1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mbd2Q9Z2E1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mbd2Q9Z2E1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mbd2Q9Z2E1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mbd2Q9Z2E1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mbd2Q9Z2E1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mbd2Q9Z2E1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mbd2Q9Z2E1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mbd2Q9Z2E1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mbd2Q9Z2E1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mbd2Q9Z2E1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mbd2Q9Z2E1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mbd2Q9Z2E1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mbd2Q9Z2E1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mbd2Q9Z2E1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mbd2Q9Z2E1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mbd2Q9Z2E1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mbd2Q9Z2E1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mbd2Q9Z2E1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mbd2Q9Z2E1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mbd2Q9Z2E1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mbd2Q9Z2E1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mbd2Q9Z2E1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mbd2Q9Z2E1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mbd2Q9Z2E1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mbd2Q9Z2E1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mbd2Q9Z2E1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mbd2Q9Z2E1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mbd2Q9Z2E1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mbd2Q9Z2E1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms