Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdpk1Q9Z2A0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pdpk1Q9Z2A0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pdpk1Q9Z2A0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdpk1Q9Z2A0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdpk1Q9Z2A0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdpk1Q9Z2A0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdpk1Q9Z2A0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdpk1Q9Z2A0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdpk1Q9Z2A0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdpk1Q9Z2A0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdpk1Q9Z2A0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdpk1Q9Z2A0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdpk1Q9Z2A0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdpk1Q9Z2A0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdpk1Q9Z2A0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdpk1Q9Z2A0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdpk1Q9Z2A0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdpk1Q9Z2A0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdpk1Q9Z2A0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdpk1Q9Z2A0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdpk1Q9Z2A0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdpk1Q9Z2A0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdpk1Q9Z2A0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdpk1Q9Z2A0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdpk1Q9Z2A0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdpk1Q9Z2A0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdpk1Q9Z2A0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdpk1Q9Z2A0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdpk1Q9Z2A0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdpk1Q9Z2A0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdpk1Q9Z2A0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdpk1Q9Z2A0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdpk1Q9Z2A0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdpk1Q9Z2A0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdpk1Q9Z2A0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdpk1Q9Z2A0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdpk1Q9Z2A0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdpk1Q9Z2A0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdpk1Q9Z2A0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdpk1Q9Z2A0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdpk1Q9Z2A0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdpk1Q9Z2A0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdpk1Q9Z2A0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdpk1Q9Z2A0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdpk1Q9Z2A0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdpk1Q9Z2A0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdpk1Q9Z2A0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdpk1Q9Z2A0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdpk1Q9Z2A0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdpk1Q9Z2A0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdpk1Q9Z2A0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdpk1Q9Z2A0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdpk1Q9Z2A0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdpk1Q9Z2A0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdpk1Q9Z2A0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdpk1Q9Z2A0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdpk1Q9Z2A0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdpk1Q9Z2A0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdpk1Q9Z2A0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdpk1Q9Z2A0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdpk1Q9Z2A0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdpk1Q9Z2A0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdpk1Q9Z2A0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdpk1Q9Z2A0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdpk1Q9Z2A0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdpk1Q9Z2A0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdpk1Q9Z2A0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdpk1Q9Z2A0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdpk1Q9Z2A0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdpk1Q9Z2A0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdpk1Q9Z2A0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdpk1Q9Z2A0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdpk1Q9Z2A0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdpk1Q9Z2A0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdpk1Q9Z2A0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdpk1Q9Z2A0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdpk1Q9Z2A0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdpk1Q9Z2A0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdpk1Q9Z2A0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdpk1Q9Z2A0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdpk1Q9Z2A0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdpk1Q9Z2A0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdpk1Q9Z2A0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdpk1Q9Z2A0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdpk1Q9Z2A0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdpk1Q9Z2A0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdpk1Q9Z2A0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pdpk1Q9Z2A0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pdpk1Q9Z2A0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdpk1Q9Z2A0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdpk1Q9Z2A0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdpk1Q9Z2A0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdpk1Q9Z2A0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 235.8 ms