Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Ap3b1Q9Z1T1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Ap3b1Q9Z1T1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Ap3b1Q9Z1T1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Ap3b1Q9Z1T1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Ap3b1Q9Z1T1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Ap3b1Q9Z1T1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Ap3b1Q9Z1T1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Ap3b1Q9Z1T1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Ap3b1Q9Z1T1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Ap3b1Q9Z1T1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Ap3b1Q9Z1T1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Ap3b1Q9Z1T1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Ap3b1Q9Z1T1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Ap3b1Q9Z1T1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Ap3b1Q9Z1T1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Ap3b1Q9Z1T1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Ap3b1Q9Z1T1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Ap3b1Q9Z1T1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Ap3b1Q9Z1T1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Ap3b1Q9Z1T1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Ap3b1Q9Z1T1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Ap3b1Q9Z1T1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Ap3b1Q9Z1T1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Ap3b1Q9Z1T1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Ap3b1Q9Z1T1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Ap3b1Q9Z1T1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Ap3b1Q9Z1T1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Ap3b1Q9Z1T1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Ap3b1Q9Z1T1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Ap3b1Q9Z1T1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Ap3b1Q9Z1T1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Ap3b1Q9Z1T1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Ap3b1Q9Z1T1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Ap3b1Q9Z1T1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Ap3b1Q9Z1T1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Ap3b1Q9Z1T1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Ap3b1Q9Z1T1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Ap3b1Q9Z1T1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Ap3b1Q9Z1T1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Ap3b1Q9Z1T1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
Ap3b1Q9Z1T1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Ap3b1Q9Z1T1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
Ap3b1Q9Z1T1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC34.2■■■■□ 3.06
Ap3b1Q9Z1T1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.06
Ap3b1Q9Z1T1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Ap3b1Q9Z1T1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Ap3b1Q9Z1T1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Ap3b1Q9Z1T1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Ap3b1Q9Z1T1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Ap3b1Q9Z1T1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Ap3b1Q9Z1T1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Ap3b1Q9Z1T1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Ap3b1Q9Z1T1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Ap3b1Q9Z1T1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Ap3b1Q9Z1T1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Ap3b1Q9Z1T1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Ap3b1Q9Z1T1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Ap3b1Q9Z1T1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Ap3b1Q9Z1T1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Ap3b1Q9Z1T1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Ap3b1Q9Z1T1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Ap3b1Q9Z1T1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Ap3b1Q9Z1T1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Ap3b1Q9Z1T1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Ap3b1Q9Z1T1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Ap3b1Q9Z1T1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
Ap3b1Q9Z1T1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Ap3b1Q9Z1T1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Ap3b1Q9Z1T1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Ap3b1Q9Z1T1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Ap3b1Q9Z1T1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Ap3b1Q9Z1T1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Ap3b1Q9Z1T1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Ap3b1Q9Z1T1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Ap3b1Q9Z1T1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Ap3b1Q9Z1T1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Ap3b1Q9Z1T1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Ap3b1Q9Z1T1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
Ap3b1Q9Z1T1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Ap3b1Q9Z1T1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Ap3b1Q9Z1T1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Ap3b1Q9Z1T1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Ap3b1Q9Z1T1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Ap3b1Q9Z1T1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Ap3b1Q9Z1T1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Ap3b1Q9Z1T1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Ap3b1Q9Z1T1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Ap3b1Q9Z1T1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Ap3b1Q9Z1T1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms