Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lgr5Q9Z1P4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lgr5Q9Z1P4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lgr5Q9Z1P4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lgr5Q9Z1P4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lgr5Q9Z1P4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lgr5Q9Z1P4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lgr5Q9Z1P4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lgr5Q9Z1P4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lgr5Q9Z1P4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lgr5Q9Z1P4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lgr5Q9Z1P4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lgr5Q9Z1P4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lgr5Q9Z1P4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lgr5Q9Z1P4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lgr5Q9Z1P4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lgr5Q9Z1P4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lgr5Q9Z1P4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Lgr5Q9Z1P4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lgr5Q9Z1P4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lgr5Q9Z1P4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lgr5Q9Z1P4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lgr5Q9Z1P4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lgr5Q9Z1P4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lgr5Q9Z1P4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lgr5Q9Z1P4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lgr5Q9Z1P4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lgr5Q9Z1P4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lgr5Q9Z1P4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lgr5Q9Z1P4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lgr5Q9Z1P4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lgr5Q9Z1P4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lgr5Q9Z1P4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lgr5Q9Z1P4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lgr5Q9Z1P4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lgr5Q9Z1P4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Lgr5Q9Z1P4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lgr5Q9Z1P4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lgr5Q9Z1P4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lgr5Q9Z1P4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lgr5Q9Z1P4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lgr5Q9Z1P4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lgr5Q9Z1P4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lgr5Q9Z1P4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lgr5Q9Z1P4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lgr5Q9Z1P4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lgr5Q9Z1P4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lgr5Q9Z1P4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lgr5Q9Z1P4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lgr5Q9Z1P4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Lgr5Q9Z1P4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lgr5Q9Z1P4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lgr5Q9Z1P4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Lgr5Q9Z1P4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lgr5Q9Z1P4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lgr5Q9Z1P4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lgr5Q9Z1P4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Lgr5Q9Z1P4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lgr5Q9Z1P4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lgr5Q9Z1P4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lgr5Q9Z1P4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lgr5Q9Z1P4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lgr5Q9Z1P4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lgr5Q9Z1P4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lgr5Q9Z1P4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lgr5Q9Z1P4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lgr5Q9Z1P4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lgr5Q9Z1P4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lgr5Q9Z1P4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lgr5Q9Z1P4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lgr5Q9Z1P4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lgr5Q9Z1P4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lgr5Q9Z1P4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lgr5Q9Z1P4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lgr5Q9Z1P4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lgr5Q9Z1P4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Lgr5Q9Z1P4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lgr5Q9Z1P4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lgr5Q9Z1P4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lgr5Q9Z1P4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lgr5Q9Z1P4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lgr5Q9Z1P4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lgr5Q9Z1P4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lgr5Q9Z1P4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lgr5Q9Z1P4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lgr5Q9Z1P4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lgr5Q9Z1P4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lgr5Q9Z1P4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lgr5Q9Z1P4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lgr5Q9Z1P4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lgr5Q9Z1P4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lgr5Q9Z1P4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lgr5Q9Z1P4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lgr5Q9Z1P4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lgr5Q9Z1P4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lgr5Q9Z1P4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lgr5Q9Z1P4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Lgr5Q9Z1P4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lgr5Q9Z1P4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lgr5Q9Z1P4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.6 ms