Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddx39bQ9Z1N5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddx39bQ9Z1N5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddx39bQ9Z1N5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddx39bQ9Z1N5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddx39bQ9Z1N5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddx39bQ9Z1N5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddx39bQ9Z1N5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddx39bQ9Z1N5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddx39bQ9Z1N5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddx39bQ9Z1N5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddx39bQ9Z1N5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddx39bQ9Z1N5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddx39bQ9Z1N5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddx39bQ9Z1N5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddx39bQ9Z1N5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddx39bQ9Z1N5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddx39bQ9Z1N5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddx39bQ9Z1N5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddx39bQ9Z1N5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddx39bQ9Z1N5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddx39bQ9Z1N5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddx39bQ9Z1N5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddx39bQ9Z1N5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddx39bQ9Z1N5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddx39bQ9Z1N5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddx39bQ9Z1N5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ddx39bQ9Z1N5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ddx39bQ9Z1N5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ddx39bQ9Z1N5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ddx39bQ9Z1N5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ddx39bQ9Z1N5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddx39bQ9Z1N5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddx39bQ9Z1N5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddx39bQ9Z1N5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddx39bQ9Z1N5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddx39bQ9Z1N5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddx39bQ9Z1N5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddx39bQ9Z1N5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddx39bQ9Z1N5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ddx39bQ9Z1N5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ddx39bQ9Z1N5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ddx39bQ9Z1N5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ddx39bQ9Z1N5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ddx39bQ9Z1N5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ddx39bQ9Z1N5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddx39bQ9Z1N5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddx39bQ9Z1N5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddx39bQ9Z1N5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddx39bQ9Z1N5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddx39bQ9Z1N5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddx39bQ9Z1N5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddx39bQ9Z1N5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddx39bQ9Z1N5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ddx39bQ9Z1N5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ddx39bQ9Z1N5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ddx39bQ9Z1N5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ddx39bQ9Z1N5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ddx39bQ9Z1N5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ddx39bQ9Z1N5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ddx39bQ9Z1N5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ddx39bQ9Z1N5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ddx39bQ9Z1N5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ddx39bQ9Z1N5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ddx39bQ9Z1N5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ddx39bQ9Z1N5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ddx39bQ9Z1N5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ddx39bQ9Z1N5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ddx39bQ9Z1N5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ddx39bQ9Z1N5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ddx39bQ9Z1N5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ddx39bQ9Z1N5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ddx39bQ9Z1N5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ddx39bQ9Z1N5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ddx39bQ9Z1N5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ddx39bQ9Z1N5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ddx39bQ9Z1N5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ddx39bQ9Z1N5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ddx39bQ9Z1N5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ddx39bQ9Z1N5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ddx39bQ9Z1N5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ddx39bQ9Z1N5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ddx39bQ9Z1N5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ddx39bQ9Z1N5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ddx39bQ9Z1N5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ddx39bQ9Z1N5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ddx39bQ9Z1N5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ddx39bQ9Z1N5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ddx39bQ9Z1N5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ddx39bQ9Z1N5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ddx39bQ9Z1N5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ddx39bQ9Z1N5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ddx39bQ9Z1N5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ddx39bQ9Z1N5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ddx39bQ9Z1N5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ddx39bQ9Z1N5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ddx39bQ9Z1N5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ddx39bQ9Z1N5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ddx39bQ9Z1N5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ddx39bQ9Z1N5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms