Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Nek4Q9Z1J2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nek4Q9Z1J2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nek4Q9Z1J2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nek4Q9Z1J2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nek4Q9Z1J2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nek4Q9Z1J2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nek4Q9Z1J2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nek4Q9Z1J2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Nek4Q9Z1J2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nek4Q9Z1J2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nek4Q9Z1J2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Nek4Q9Z1J2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Nek4Q9Z1J2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Nek4Q9Z1J2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Nek4Q9Z1J2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nek4Q9Z1J2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nek4Q9Z1J2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nek4Q9Z1J2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nek4Q9Z1J2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nek4Q9Z1J2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nek4Q9Z1J2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nek4Q9Z1J2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nek4Q9Z1J2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nek4Q9Z1J2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nek4Q9Z1J2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nek4Q9Z1J2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nek4Q9Z1J2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nek4Q9Z1J2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nek4Q9Z1J2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nek4Q9Z1J2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nek4Q9Z1J2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Nek4Q9Z1J2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Nek4Q9Z1J2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Nek4Q9Z1J2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nek4Q9Z1J2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nek4Q9Z1J2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nek4Q9Z1J2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nek4Q9Z1J2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nek4Q9Z1J2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Nek4Q9Z1J2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nek4Q9Z1J2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nek4Q9Z1J2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nek4Q9Z1J2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nek4Q9Z1J2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nek4Q9Z1J2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nek4Q9Z1J2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nek4Q9Z1J2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nek4Q9Z1J2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nek4Q9Z1J2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nek4Q9Z1J2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nek4Q9Z1J2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nek4Q9Z1J2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nek4Q9Z1J2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nek4Q9Z1J2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nek4Q9Z1J2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nek4Q9Z1J2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nek4Q9Z1J2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nek4Q9Z1J2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nek4Q9Z1J2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nek4Q9Z1J2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nek4Q9Z1J2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nek4Q9Z1J2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Nek4Q9Z1J2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nek4Q9Z1J2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Nek4Q9Z1J2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nek4Q9Z1J2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nek4Q9Z1J2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nek4Q9Z1J2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nek4Q9Z1J2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nek4Q9Z1J2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nek4Q9Z1J2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nek4Q9Z1J2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nek4Q9Z1J2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nek4Q9Z1J2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nek4Q9Z1J2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Nek4Q9Z1J2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Nek4Q9Z1J2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Nek4Q9Z1J2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nek4Q9Z1J2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nek4Q9Z1J2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nek4Q9Z1J2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nek4Q9Z1J2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Nek4Q9Z1J2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nek4Q9Z1J2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nek4Q9Z1J2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Nek4Q9Z1J2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Nek4Q9Z1J2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nek4Q9Z1J2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nek4Q9Z1J2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Nek4Q9Z1J2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Nek4Q9Z1J2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nek4Q9Z1J2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nek4Q9Z1J2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nek4Q9Z1J2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nek4Q9Z1J2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nek4Q9Z1J2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Nek4Q9Z1J2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nek4Q9Z1J2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nek4Q9Z1J2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms