Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NgfrQ9Z0W1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NgfrQ9Z0W1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NgfrQ9Z0W1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NgfrQ9Z0W1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NgfrQ9Z0W1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NgfrQ9Z0W1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NgfrQ9Z0W1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NgfrQ9Z0W1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NgfrQ9Z0W1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NgfrQ9Z0W1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NgfrQ9Z0W1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NgfrQ9Z0W1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NgfrQ9Z0W1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NgfrQ9Z0W1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NgfrQ9Z0W1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NgfrQ9Z0W1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NgfrQ9Z0W1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NgfrQ9Z0W1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NgfrQ9Z0W1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NgfrQ9Z0W1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NgfrQ9Z0W1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NgfrQ9Z0W1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NgfrQ9Z0W1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NgfrQ9Z0W1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NgfrQ9Z0W1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NgfrQ9Z0W1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NgfrQ9Z0W1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NgfrQ9Z0W1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NgfrQ9Z0W1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NgfrQ9Z0W1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NgfrQ9Z0W1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NgfrQ9Z0W1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NgfrQ9Z0W1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NgfrQ9Z0W1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NgfrQ9Z0W1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NgfrQ9Z0W1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NgfrQ9Z0W1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NgfrQ9Z0W1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NgfrQ9Z0W1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NgfrQ9Z0W1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NgfrQ9Z0W1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NgfrQ9Z0W1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NgfrQ9Z0W1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NgfrQ9Z0W1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NgfrQ9Z0W1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NgfrQ9Z0W1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NgfrQ9Z0W1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NgfrQ9Z0W1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NgfrQ9Z0W1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NgfrQ9Z0W1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NgfrQ9Z0W1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NgfrQ9Z0W1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NgfrQ9Z0W1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NgfrQ9Z0W1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
NgfrQ9Z0W1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NgfrQ9Z0W1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NgfrQ9Z0W1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NgfrQ9Z0W1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NgfrQ9Z0W1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NgfrQ9Z0W1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NgfrQ9Z0W1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NgfrQ9Z0W1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NgfrQ9Z0W1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NgfrQ9Z0W1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NgfrQ9Z0W1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NgfrQ9Z0W1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NgfrQ9Z0W1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NgfrQ9Z0W1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NgfrQ9Z0W1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NgfrQ9Z0W1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NgfrQ9Z0W1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NgfrQ9Z0W1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NgfrQ9Z0W1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NgfrQ9Z0W1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NgfrQ9Z0W1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NgfrQ9Z0W1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NgfrQ9Z0W1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NgfrQ9Z0W1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NgfrQ9Z0W1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NgfrQ9Z0W1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NgfrQ9Z0W1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NgfrQ9Z0W1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NgfrQ9Z0W1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NgfrQ9Z0W1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NgfrQ9Z0W1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NgfrQ9Z0W1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NgfrQ9Z0W1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NgfrQ9Z0W1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NgfrQ9Z0W1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NgfrQ9Z0W1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NgfrQ9Z0W1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NgfrQ9Z0W1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NgfrQ9Z0W1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NgfrQ9Z0W1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NgfrQ9Z0W1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NgfrQ9Z0W1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NgfrQ9Z0W1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NgfrQ9Z0W1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NgfrQ9Z0W1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms