Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Scnn1bQ9WU38 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Scnn1bQ9WU38 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Scnn1bQ9WU38 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Scnn1bQ9WU38 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Scnn1bQ9WU38 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Scnn1bQ9WU38 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Scnn1bQ9WU38 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scnn1bQ9WU38 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scnn1bQ9WU38 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scnn1bQ9WU38 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scnn1bQ9WU38 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scnn1bQ9WU38 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scnn1bQ9WU38 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scnn1bQ9WU38 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scnn1bQ9WU38 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scnn1bQ9WU38 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scnn1bQ9WU38 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scnn1bQ9WU38 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scnn1bQ9WU38 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scnn1bQ9WU38 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scnn1bQ9WU38 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scnn1bQ9WU38 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scnn1bQ9WU38 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scnn1bQ9WU38 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scnn1bQ9WU38 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scnn1bQ9WU38 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Scnn1bQ9WU38 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Scnn1bQ9WU38 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Scnn1bQ9WU38 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Scnn1bQ9WU38 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scnn1bQ9WU38 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scnn1bQ9WU38 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scnn1bQ9WU38 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Scnn1bQ9WU38 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scnn1bQ9WU38 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scnn1bQ9WU38 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scnn1bQ9WU38 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scnn1bQ9WU38 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scnn1bQ9WU38 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scnn1bQ9WU38 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scnn1bQ9WU38 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scnn1bQ9WU38 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scnn1bQ9WU38 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scnn1bQ9WU38 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scnn1bQ9WU38 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scnn1bQ9WU38 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scnn1bQ9WU38 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scnn1bQ9WU38 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Scnn1bQ9WU38 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Scnn1bQ9WU38 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Scnn1bQ9WU38 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Scnn1bQ9WU38 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scnn1bQ9WU38 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scnn1bQ9WU38 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Scnn1bQ9WU38 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Scnn1bQ9WU38 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scnn1bQ9WU38 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scnn1bQ9WU38 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Scnn1bQ9WU38 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Scnn1bQ9WU38 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Scnn1bQ9WU38 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Scnn1bQ9WU38 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scnn1bQ9WU38 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scnn1bQ9WU38 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scnn1bQ9WU38 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scnn1bQ9WU38 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scnn1bQ9WU38 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Scnn1bQ9WU38 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Scnn1bQ9WU38 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Scnn1bQ9WU38 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Scnn1bQ9WU38 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Scnn1bQ9WU38 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Scnn1bQ9WU38 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Scnn1bQ9WU38 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scnn1bQ9WU38 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scnn1bQ9WU38 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scnn1bQ9WU38 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scnn1bQ9WU38 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scnn1bQ9WU38 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scnn1bQ9WU38 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Scnn1bQ9WU38 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scnn1bQ9WU38 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scnn1bQ9WU38 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scnn1bQ9WU38 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scnn1bQ9WU38 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scnn1bQ9WU38 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scnn1bQ9WU38 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scnn1bQ9WU38 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Scnn1bQ9WU38 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Scnn1bQ9WU38 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scnn1bQ9WU38 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scnn1bQ9WU38 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Scnn1bQ9WU38 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Scnn1bQ9WU38 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scnn1bQ9WU38 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scnn1bQ9WU38 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scnn1bQ9WU38 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scnn1bQ9WU38 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scnn1bQ9WU38 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms