Protein–RNA interactions for Protein: Q9R060

Nubp1, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP1, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nubp1Q9R060 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC19,1■□□□□ 0,65
Nubp1Q9R060 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,1■□□□□ 0,65
Nubp1Q9R060 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,1■□□□□ 0,65
Nubp1Q9R060 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19,1■□□□□ 0,65
Nubp1Q9R060 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,1■□□□□ 0,65
Nubp1Q9R060 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19,09■□□□□ 0,65
Nubp1Q9R060 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19,09■□□□□ 0,65
Nubp1Q9R060 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,09■□□□□ 0,65
Nubp1Q9R060 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19,09■□□□□ 0,65
Nubp1Q9R060 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,09■□□□□ 0,65
Nubp1Q9R060 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,08■□□□□ 0,65
Nubp1Q9R060 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,08■□□□□ 0,65
Nubp1Q9R060 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,08■□□□□ 0,65
Nubp1Q9R060 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,08■□□□□ 0,65
Nubp1Q9R060 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,08■□□□□ 0,65
Nubp1Q9R060 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,08■□□□□ 0,65
Nubp1Q9R060 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19,08■□□□□ 0,64
Nubp1Q9R060 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,08■□□□□ 0,64
Nubp1Q9R060 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19,08■□□□□ 0,64
Nubp1Q9R060 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19,08■□□□□ 0,64
Nubp1Q9R060 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,08■□□□□ 0,64
Nubp1Q9R060 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,07■□□□□ 0,64
Nubp1Q9R060 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,07■□□□□ 0,64
Nubp1Q9R060 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19,07■□□□□ 0,64
Nubp1Q9R060 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19,07■□□□□ 0,64
Nubp1Q9R060 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,07■□□□□ 0,64
Nubp1Q9R060 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,07■□□□□ 0,64
Nubp1Q9R060 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19,07■□□□□ 0,64
Nubp1Q9R060 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,06■□□□□ 0,64
Nubp1Q9R060 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,06■□□□□ 0,64
Nubp1Q9R060 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19,06■□□□□ 0,64
Nubp1Q9R060 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19,06■□□□□ 0,64
Nubp1Q9R060 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19,06■□□□□ 0,64
Nubp1Q9R060 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19,06■□□□□ 0,64
Nubp1Q9R060 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,05■□□□□ 0,64
Nubp1Q9R060 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,05■□□□□ 0,64
Nubp1Q9R060 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,05■□□□□ 0,64
Nubp1Q9R060 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,05■□□□□ 0,64
Nubp1Q9R060 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,05■□□□□ 0,64
Nubp1Q9R060 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19,04■□□□□ 0,64
Nubp1Q9R060 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,04■□□□□ 0,64
Nubp1Q9R060 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,04■□□□□ 0,64
Nubp1Q9R060 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19,04■□□□□ 0,64
Nubp1Q9R060 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19,03■□□□□ 0,64
Nubp1Q9R060 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19,03■□□□□ 0,64
Nubp1Q9R060 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,03■□□□□ 0,64
Nubp1Q9R060 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,03■□□□□ 0,64
Nubp1Q9R060 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,03■□□□□ 0,64
Nubp1Q9R060 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19,03■□□□□ 0,64
Nubp1Q9R060 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,03■□□□□ 0,64
Nubp1Q9R060 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,02■□□□□ 0,64
Nubp1Q9R060 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,02■□□□□ 0,64
Nubp1Q9R060 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19,02■□□□□ 0,64
Nubp1Q9R060 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19,02■□□□□ 0,64
Nubp1Q9R060 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19,02■□□□□ 0,63
Nubp1Q9R060 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,02■□□□□ 0,63
Nubp1Q9R060 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,02■□□□□ 0,63
Nubp1Q9R060 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19,02■□□□□ 0,63
Nubp1Q9R060 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,01■□□□□ 0,63
Nubp1Q9R060 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19,01■□□□□ 0,63
Nubp1Q9R060 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19,01■□□□□ 0,63
Nubp1Q9R060 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,01■□□□□ 0,63
Nubp1Q9R060 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,01■□□□□ 0,63
Nubp1Q9R060 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0,63
Nubp1Q9R060 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0,63
Nubp1Q9R060 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0,63
Nubp1Q9R060 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0,63
Nubp1Q9R060 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0,63
Nubp1Q9R060 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0,63
Nubp1Q9R060 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0,63
Nubp1Q9R060 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,99■□□□□ 0,63
Nubp1Q9R060 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18,99■□□□□ 0,63
Nubp1Q9R060 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18,99■□□□□ 0,63
Nubp1Q9R060 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18,99■□□□□ 0,63
Nubp1Q9R060 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18,98■□□□□ 0,63
Nubp1Q9R060 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18,98■□□□□ 0,63
Nubp1Q9R060 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18,98■□□□□ 0,63
Nubp1Q9R060 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,98■□□□□ 0,63
Nubp1Q9R060 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,98■□□□□ 0,63
Nubp1Q9R060 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,97■□□□□ 0,63
Nubp1Q9R060 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18,97■□□□□ 0,63
Nubp1Q9R060 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18,97■□□□□ 0,63
Nubp1Q9R060 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18,97■□□□□ 0,63
Nubp1Q9R060 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18,97■□□□□ 0,63
Nubp1Q9R060 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18,97■□□□□ 0,63
Nubp1Q9R060 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18,97■□□□□ 0,63
Nubp1Q9R060 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,97■□□□□ 0,63
Nubp1Q9R060 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18,97■□□□□ 0,63
Nubp1Q9R060 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,97■□□□□ 0,63
Nubp1Q9R060 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,97■□□□□ 0,63
Nubp1Q9R060 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,97■□□□□ 0,63
Nubp1Q9R060 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,97■□□□□ 0,63
Nubp1Q9R060 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,96■□□□□ 0,63
Nubp1Q9R060 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18,96■□□□□ 0,63
Nubp1Q9R060 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18,96■□□□□ 0,63
Nubp1Q9R060 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,96■□□□□ 0,63
Nubp1Q9R060 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18,96■□□□□ 0,63
Nubp1Q9R060 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18,96■□□□□ 0,63
Nubp1Q9R060 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,95■□□□□ 0,62
Nubp1Q9R060 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,95■□□□□ 0,62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45,2 ms