Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Tnnt3Q9QZ47 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Tnnt3Q9QZ47 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Tnnt3Q9QZ47 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Tnnt3Q9QZ47 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Tnnt3Q9QZ47 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tnnt3Q9QZ47 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tnnt3Q9QZ47 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tnnt3Q9QZ47 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tnnt3Q9QZ47 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tnnt3Q9QZ47 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tnnt3Q9QZ47 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Tnnt3Q9QZ47 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Tnnt3Q9QZ47 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Tnnt3Q9QZ47 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Tnnt3Q9QZ47 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Tnnt3Q9QZ47 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Tnnt3Q9QZ47 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Tnnt3Q9QZ47 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Tnnt3Q9QZ47 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Tnnt3Q9QZ47 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Tnnt3Q9QZ47 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Tnnt3Q9QZ47 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Tnnt3Q9QZ47 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Tnnt3Q9QZ47 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Tnnt3Q9QZ47 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tnnt3Q9QZ47 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tnnt3Q9QZ47 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tnnt3Q9QZ47 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tnnt3Q9QZ47 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tnnt3Q9QZ47 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tnnt3Q9QZ47 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tnnt3Q9QZ47 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tnnt3Q9QZ47 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tnnt3Q9QZ47 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tnnt3Q9QZ47 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tnnt3Q9QZ47 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tnnt3Q9QZ47 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tnnt3Q9QZ47 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tnnt3Q9QZ47 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tnnt3Q9QZ47 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tnnt3Q9QZ47 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tnnt3Q9QZ47 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tnnt3Q9QZ47 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Tnnt3Q9QZ47 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Tnnt3Q9QZ47 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Tnnt3Q9QZ47 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Tnnt3Q9QZ47 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Tnnt3Q9QZ47 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Tnnt3Q9QZ47 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Tnnt3Q9QZ47 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Tnnt3Q9QZ47 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Tnnt3Q9QZ47 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Tnnt3Q9QZ47 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tnnt3Q9QZ47 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tnnt3Q9QZ47 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tnnt3Q9QZ47 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tnnt3Q9QZ47 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tnnt3Q9QZ47 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Tnnt3Q9QZ47 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tnnt3Q9QZ47 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tnnt3Q9QZ47 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tnnt3Q9QZ47 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tnnt3Q9QZ47 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tnnt3Q9QZ47 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tnnt3Q9QZ47 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Tnnt3Q9QZ47 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Tnnt3Q9QZ47 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Tnnt3Q9QZ47 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Tnnt3Q9QZ47 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Tnnt3Q9QZ47 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Tnnt3Q9QZ47 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Tnnt3Q9QZ47 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Tnnt3Q9QZ47 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Tnnt3Q9QZ47 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Tnnt3Q9QZ47 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Tnnt3Q9QZ47 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Tnnt3Q9QZ47 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Tnnt3Q9QZ47 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Tnnt3Q9QZ47 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Tnnt3Q9QZ47 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Tnnt3Q9QZ47 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tnnt3Q9QZ47 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tnnt3Q9QZ47 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tnnt3Q9QZ47 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tnnt3Q9QZ47 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tnnt3Q9QZ47 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tnnt3Q9QZ47 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tnnt3Q9QZ47 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tnnt3Q9QZ47 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tnnt3Q9QZ47 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tnnt3Q9QZ47 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tnnt3Q9QZ47 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tnnt3Q9QZ47 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tnnt3Q9QZ47 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tnnt3Q9QZ47 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tnnt3Q9QZ47 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tnnt3Q9QZ47 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tnnt3Q9QZ47 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms