Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX11

Cyth1, Cytohesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyth1Q9QX11 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cyth1Q9QX11 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cyth1Q9QX11 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cyth1Q9QX11 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyth1Q9QX11 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyth1Q9QX11 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyth1Q9QX11 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyth1Q9QX11 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyth1Q9QX11 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyth1Q9QX11 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyth1Q9QX11 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyth1Q9QX11 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyth1Q9QX11 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyth1Q9QX11 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyth1Q9QX11 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyth1Q9QX11 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyth1Q9QX11 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyth1Q9QX11 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyth1Q9QX11 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyth1Q9QX11 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyth1Q9QX11 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyth1Q9QX11 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyth1Q9QX11 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyth1Q9QX11 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyth1Q9QX11 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyth1Q9QX11 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyth1Q9QX11 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyth1Q9QX11 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyth1Q9QX11 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyth1Q9QX11 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyth1Q9QX11 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyth1Q9QX11 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyth1Q9QX11 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyth1Q9QX11 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyth1Q9QX11 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyth1Q9QX11 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyth1Q9QX11 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyth1Q9QX11 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyth1Q9QX11 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyth1Q9QX11 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyth1Q9QX11 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyth1Q9QX11 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyth1Q9QX11 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyth1Q9QX11 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyth1Q9QX11 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyth1Q9QX11 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyth1Q9QX11 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyth1Q9QX11 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyth1Q9QX11 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyth1Q9QX11 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyth1Q9QX11 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyth1Q9QX11 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyth1Q9QX11 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyth1Q9QX11 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyth1Q9QX11 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyth1Q9QX11 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyth1Q9QX11 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyth1Q9QX11 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyth1Q9QX11 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyth1Q9QX11 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyth1Q9QX11 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyth1Q9QX11 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyth1Q9QX11 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyth1Q9QX11 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyth1Q9QX11 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyth1Q9QX11 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyth1Q9QX11 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyth1Q9QX11 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyth1Q9QX11 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyth1Q9QX11 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyth1Q9QX11 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyth1Q9QX11 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyth1Q9QX11 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyth1Q9QX11 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cyth1Q9QX11 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyth1Q9QX11 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyth1Q9QX11 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyth1Q9QX11 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyth1Q9QX11 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyth1Q9QX11 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyth1Q9QX11 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyth1Q9QX11 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyth1Q9QX11 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyth1Q9QX11 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyth1Q9QX11 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyth1Q9QX11 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyth1Q9QX11 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyth1Q9QX11 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyth1Q9QX11 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyth1Q9QX11 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyth1Q9QX11 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyth1Q9QX11 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyth1Q9QX11 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyth1Q9QX11 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyth1Q9QX11 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyth1Q9QX11 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyth1Q9QX11 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyth1Q9QX11 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyth1Q9QX11 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyth1Q9QX11 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms