Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mid2Q9QUS6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mid2Q9QUS6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mid2Q9QUS6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mid2Q9QUS6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mid2Q9QUS6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mid2Q9QUS6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mid2Q9QUS6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mid2Q9QUS6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mid2Q9QUS6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mid2Q9QUS6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mid2Q9QUS6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mid2Q9QUS6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mid2Q9QUS6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mid2Q9QUS6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mid2Q9QUS6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mid2Q9QUS6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mid2Q9QUS6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mid2Q9QUS6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Mid2Q9QUS6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Mid2Q9QUS6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mid2Q9QUS6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mid2Q9QUS6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mid2Q9QUS6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Mid2Q9QUS6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mid2Q9QUS6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mid2Q9QUS6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mid2Q9QUS6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mid2Q9QUS6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Mid2Q9QUS6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mid2Q9QUS6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mid2Q9QUS6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mid2Q9QUS6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mid2Q9QUS6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mid2Q9QUS6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mid2Q9QUS6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mid2Q9QUS6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mid2Q9QUS6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mid2Q9QUS6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mid2Q9QUS6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mid2Q9QUS6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mid2Q9QUS6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mid2Q9QUS6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mid2Q9QUS6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mid2Q9QUS6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mid2Q9QUS6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Mid2Q9QUS6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mid2Q9QUS6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mid2Q9QUS6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mid2Q9QUS6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mid2Q9QUS6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mid2Q9QUS6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mid2Q9QUS6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mid2Q9QUS6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mid2Q9QUS6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mid2Q9QUS6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Mid2Q9QUS6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mid2Q9QUS6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mid2Q9QUS6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mid2Q9QUS6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mid2Q9QUS6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mid2Q9QUS6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mid2Q9QUS6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mid2Q9QUS6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mid2Q9QUS6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mid2Q9QUS6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mid2Q9QUS6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mid2Q9QUS6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mid2Q9QUS6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mid2Q9QUS6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mid2Q9QUS6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mid2Q9QUS6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mid2Q9QUS6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mid2Q9QUS6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mid2Q9QUS6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mid2Q9QUS6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mid2Q9QUS6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mid2Q9QUS6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mid2Q9QUS6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mid2Q9QUS6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mid2Q9QUS6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mid2Q9QUS6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mid2Q9QUS6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mid2Q9QUS6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Mid2Q9QUS6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mid2Q9QUS6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Mid2Q9QUS6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Mid2Q9QUS6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mid2Q9QUS6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mid2Q9QUS6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mid2Q9QUS6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Mid2Q9QUS6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mid2Q9QUS6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mid2Q9QUS6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mid2Q9QUS6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mid2Q9QUS6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Mid2Q9QUS6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mid2Q9QUS6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Mid2Q9QUS6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mid2Q9QUS6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.1 ms